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近日,人类Y染色体的完整序列,终于首次被科学家们完全破译,这也意味着人类泛基因组的最后一块拼图被拼上,完全破译Y染色体,将对人类文明生殖领域的相关研究有重大意义,未来将对男性健康繁殖、进化、癌症等重要问题提供方向。
Y染色体
人类基因组,由23对染色体组成,其中包括22对常染色体,1对性染色体。几十年以来,作为人类两条性染色体之一的Y染色体,由于其结构的复杂性,始终未被基因组学界完全测序。
在最新一期《Nature》上面,加州大学圣克鲁斯分校与国际科研团队“端粒到端粒”联盟(T2T),重磅发布了一篇“The complete sequence of a human Y chromosome”的论文,成功破译了人类Y染色体的完整序列。
人类基因组含有约31.6亿个DNA碱基对,Y染色体是决定生物个体性别的性染色体的一种,男性的一对性染色体由一条x染色体和一条较小的y染色体组成。
由于Y染色体传男不传女的特性,所以Y-DNA分析也被常常用于家族历史的研究,特别是中国古代皇族家庭,历史记载可能靠不住,姓氏谱系也不靠谱,但是分子人类学不会说谎。
目前,Y染色体的完整序列可在UCSC大学基因组浏览器上查阅和使用,通过Github也可访问。
论文中提供了人类Y染色体完整的62460029个碱基对,其中有3000万个约一半碱基对都是本次的新发现,这一次补齐并纠正了GRCh38-Y中的多处错误,对人类未来研究繁殖(比如Y染色体导致的不孕不育)、进化、癌症等重要问题提供方向。
Y染色体之所以难测,是因为其中有大量的重复序列,约有3000万个碱基是重复序列,因此要把测序读取到的片段重新拼装起来就特别困难,就像是在拼图时遇到的大量形状类似的拼图。
为了解决这一难题,T2T联盟领导的这项新研究应用了前沿的长读取测序技术(Long read)和新型的计算组装方法,借鉴此前无缝组装人类其他染色体时的成功经验,首次完成了Y染色体的测序和组装。
根据此次获得的完整序列(T2T-Y),科学家们从中新鉴定出了41个过去未知的蛋白编码基因,这也揭示了影响生育的重要基因组特征。
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